4 декабря 2013 года, митрополит Астанайский и Казахстанский Александр в Иверско-Серафимовском домовом храме митрополичьей резиденции в Алма-Ате совершил панихиду по новопреставленному архиепископу Костромскому и Галичскому Алексию.
Архиепископ Алексий преставился ко Господу 3 декабря 2013 года после тяжелой и продолжительной болезни на 67-м году жизни.
Глава Православной Церкви Казахстана выразил соболезнования епископу Макарьевскому Ферапонту, клиру и пастве Костромской епархии, в котором, в частности, говорится: «Узнав о кончине архиепископа Костромского и Галичского Алексия, выражаю соболезнование священнослужителям и пастве богохранимой Костромской земли, всем родным и близким покойного, руководству города и области.
Для верующих сердец во всех жизненных обстоятельствах утешением и поддержкой звучат слова апостола Павла: «Аще бо живем, Господеви живем, аще же умираем, Господеви умираем: аще убо живем, аще умираем, Господни есмы» (Рим. 14:8).
Без малого два десятилетия владыка Алексий нес крест архиерейского служения и выполнял различные общецерковные послушания, возлагаемые на него священноначалием. На протяжении трех лет, возглавляя Костромскую епархию, он являлся хранителем великого духовного сокровища – чудотворной Феодоровской иконы Божией Матери и святынь, связанных с подвигами многочисленных подвижников Православия, преподобных и богоносных отцов Северной Фиваиды.
Разделяя скорбь жителей Костромского края и духовных чад почившего, молюсь пред престолом Божиим, да упокоит милосердный Господь душу новопреставленного Высокопреосвященнейшего архиепископа Алексия «где нет ни болезни, ни печали, ни воздыхания, но жизнь бесконечная».
Вечная и блаженная память новопреставленному архиепископу Алексию».